mahout-dev mailing list archives

Site index · List index
Message view « Date » · « Thread »
Top « Date » · « Thread »
From "Andrew Palumbo (JIRA)" <j...@apache.org>
Subject [jira] [Assigned] (MAHOUT-1892) Can't broadcast vector in Mahout-Shell
Date Sat, 31 Dec 2016 22:01:58 GMT

     [ https://issues.apache.org/jira/browse/MAHOUT-1892?page=com.atlassian.jira.plugin.system.issuetabpanels:all-tabpanel
]

Andrew Palumbo reassigned MAHOUT-1892:
--------------------------------------

    Assignee: Andrew Palumbo

> Can't broadcast vector in Mahout-Shell
> --------------------------------------
>
>                 Key: MAHOUT-1892
>                 URL: https://issues.apache.org/jira/browse/MAHOUT-1892
>             Project: Mahout
>          Issue Type: Bug
>    Affects Versions: 0.12.2
>            Reporter: Trevor Grant
>            Assignee: Andrew Palumbo
>            Priority: Blocker
>             Fix For: 0.13.0
>
>
> When attempting to broadcast a Vector in Mahout's spark-shell with `mapBlock` we get
serialization errors.  **NOTE** scalars can be broadcast without issue.
> I did some testing in the "Zeppelin Shell" for lack of a better term.  See https://github.com/apache/zeppelin/pull/928
> The `mapBlock` same code I ran in the spark-shell below, also generated errors.  However,
wrapping a mapBlock into a function in a compiled jar https://github.com/apache/mahout/pull/246/commits/ccb5da65330e394763928f6dc51d96e38debe4fb#diff-4a952e8e09ae07e0b3a7ac6a5d6b2734R25
and then running said function from the Mahout Shell or in the "Zeppelin Shell" (using Spark
or Flink as a runner) works fine.  
> Consider
> ```
> mahout> val inCoreA = dense((1, 2, 3), (3, 4, 5))
> val A = drmParallelize(inCoreA)
> val v: Vector = dvec(1,1,1)
> val bcastV = drmBroadcast(v)
> val drm2 = A.mapBlock() {
>     case (keys, block) =>
>         for(row <- 0 until block.nrow) block(row, ::) -= bcastV
>     keys -> block    
> }
> drm2.checkpoint()
> ```
> Which emits the stack trace:
> ```
> org.apache.spark.SparkException: Task not serializable
>         at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.ensureSerializable(ClosureCleaner.scala:304)
>         at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.org$apache$spark$util$ClosureCleaner$$clean(ClosureCleaner.scala:294)
>         at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.clean(ClosureCleaner.scala:122)
>         at org.apache.spark.SparkContext.clean(SparkContext.scala:2032)
>         at org.apache.spark.rdd.RDD$$anonfun$map$1.apply(RDD.scala:318)
>         at org.apache.spark.rdd.RDD$$anonfun$map$1.apply(RDD.scala:317)
>         at org.apache.spark.rdd.RDDOperationScope$.withScope(RDDOperationScope.scala:147)
>         at org.apache.spark.rdd.RDDOperationScope$.withScope(RDDOperationScope.scala:108)
>         at org.apache.spark.rdd.RDD.withScope(RDD.scala:310)
>         at org.apache.spark.rdd.RDD.map(RDD.scala:317)
>         at org.apache.mahout.sparkbindings.blas.MapBlock$.exec(MapBlock.scala:33)
>         at org.apache.mahout.sparkbindings.SparkEngine$.tr2phys(SparkEngine.scala:338)
>         at org.apache.mahout.sparkbindings.SparkEngine$.toPhysical(SparkEngine.scala:116)
>         at org.apache.mahout.math.drm.logical.CheckpointAction.checkpoint(CheckpointAction.scala:41)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:58)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:68)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:70)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:72)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:74)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:76)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:78)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:80)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:82)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:84)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:86)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:88)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:90)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:92)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:94)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:96)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:98)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:100)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:102)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:104)
>         at $iwC$$iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:106)
>         at $iwC$$iwC$$iwC.<init>(<console>:108)
>         at $iwC$$iwC.<init>(<console>:110)
>         at $iwC.<init>(<console>:112)
>         at <init>(<console>:114)
>         at .<init>(<console>:118)
>         at .<clinit>(<console>)
>         at .<init>(<console>:7)
>         at .<clinit>(<console>)
>         at $print(<console>)
>         at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
>         at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:62)
>         at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)
>         at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:498)
>         at org.apache.spark.repl.SparkIMain$ReadEvalPrint.call(SparkIMain.scala:1065)
>         at org.apache.spark.repl.SparkIMain$Request.loadAndRun(SparkIMain.scala:1340)
>         at org.apache.spark.repl.SparkIMain.loadAndRunReq$1(SparkIMain.scala:840)
>         at org.apache.spark.repl.SparkIMain.interpret(SparkIMain.scala:871)
>         at org.apache.spark.repl.SparkIMain.interpret(SparkIMain.scala:819)
>         at org.apache.spark.repl.SparkILoop.reallyInterpret$1(SparkILoop.scala:857)
>         at org.apache.spark.repl.SparkILoop.interpretStartingWith(SparkILoop.scala:902)
>         at org.apache.spark.repl.SparkILoop.command(SparkILoop.scala:814)
>         at org.apache.spark.repl.SparkILoop.processLine$1(SparkILoop.scala:657)
>         at org.apache.spark.repl.SparkILoop.innerLoop$1(SparkILoop.scala:665)
>         at org.apache.spark.repl.SparkILoop.org$apache$spark$repl$SparkILoop$$loop(SparkILoop.scala:670)
>         at org.apache.spark.repl.SparkILoop$$anonfun$org$apache$spark$repl$SparkILoop$$process$1.apply$mcZ$sp(SparkILoop.scala:997)
>         at org.apache.spark.repl.SparkILoop$$anonfun$org$apache$spark$repl$SparkILoop$$process$1.apply(SparkILoop.scala:945)
>         at org.apache.spark.repl.SparkILoop$$anonfun$org$apache$spark$repl$SparkILoop$$process$1.apply(SparkILoop.scala:945)
>         at scala.tools.nsc.util.ScalaClassLoader$.savingContextLoader(ScalaClassLoader.scala:135)
>         at org.apache.spark.repl.SparkILoop.org$apache$spark$repl$SparkILoop$$process(SparkILoop.scala:945)
>         at org.apache.spark.repl.SparkILoop.process(SparkILoop.scala:1059)
>         at org.apache.mahout.sparkbindings.shell.Main$.main(Main.scala:37)
>         at org.apache.mahout.sparkbindings.shell.Main.main(Main.scala)
> Caused by: java.io.NotSerializableException: org.apache.mahout.sparkbindings.drm.CheckpointedDrmSpark
> Serialization stack:
>         - object not serializable (class: org.apache.mahout.sparkbindings.drm.CheckpointedDrmSpark,
value: org.apache.mahout.sparkbindings.drm.CheckpointedDrmSpark@2d1c2fe7)
>         - field (class: $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC,
name: A, type: interface org.apache.mahout.math.drm.CheckpointedDrm)
>         - object (class $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC,
$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC@291be813)
>         - field (class: $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$anonfun$1,
name: $outer, type: class $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC)
>         - object (class $iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$iwC$$anonfun$1,
<function1>)
>         - field (class: org.apache.mahout.sparkbindings.blas.MapBlock$$anonfun$exec$2,
name: bmf$1, type: interface scala.Function1)
>         - object (class org.apache.mahout.sparkbindings.blas.MapBlock$$anonfun$exec$2,
<function1>)
>         at org.apache.spark.serializer.SerializationDebugger$.improveException(SerializationDebugger.scala:40)
>         at org.apache.spark.serializer.JavaSerializationStream.writeObject(JavaSerializer.scala:47)
>         at org.apache.spark.serializer.JavaSerializerInstance.serialize(JavaSerializer.scala:84)
>         at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.ensureSerializable(ClosureCleaner.scala:301)
>         ... 66 more
> ```



--
This message was sent by Atlassian JIRA
(v6.3.4#6332)

Mime
View raw message